Mistřice patří do povodí Moravy (subpovodí Březnice a Olšavy) ve Zlínském kraji a řeka Morava, i na základě zkušeností s katastrofálními povodněmi z roku 1997, je významným recipientem toků z Mistřic. Mistřický potok (bezejmenný tok 408 640 000 600) a řeka Březnice jsou hlavními většími toky katastru obce Mistřice a patří do povodí Moravy ve Zlínském kraji. Z hlediska možného povodňového ohrožení se tyto toky vyznačují vyšší rychlostí povodňové vlny z důvodu stoku z hřebenů Prakšické vrchoviny, jejichž vrcholky dosahují výšek 350 - 450 m n.m.. U řeky Březnice jde o povodeň vleklého, o to však výrazně mnohem více ohrožujícího typu, naštěstí v části Mistřice II není zatím žádná výstavba a jde o volně rozlivnou plochu.
Z hlediska možného povodňového ohrožení se toky Mistřický potok a Olšovec vyznačují vyšší rychlostí povodňové vlny z důvodu zdrojového kopcovitého masivu Prakšické vrchoviny, jejichž vrcholky dosahují výšek 355 - 390 m m.
Obr. 1 Katastr obce Mistřice – směry zdrojů a rozlivů Mistřického potoku a potoku Olšovec s přítoky v zástavbě obce se směry stoku kritických srážek a rozlivová území. zdroj - POVIS
Nebezpečí hrozí jak z letních přívalových, tak déletrvajících vodnatých srážek.
Ledové jevy, které by ohrožovaly obec Mistřice se ve významnější míře nevyskytují. Pokud by došlo k zalednění na Mistřickém potoku nebo Olšovci, je tento jev výrazně omezen bystřinným charakterem toků a kaskádou retenčních rybníků na Olšovci, kdy k nápěchům nemůže na mostcích a lávkách docházet. Na druhé straně ovšem hrozí významné zvýšení hladin při jarním tání sněhové pokrývky doprovázeném dešťovými srážkami.